СХТП и НДС: можно ли зачесть превышение по одной деятельности в счет другой? Короткий ответ: не автоматически. Если сельхозтоваропроизводитель ведет одновременно сельскохозяйственную и иную деятельность, он обязан вести раздельный учет НДС (ст. 490 НК РК). Что важно знать: - раздельный учет нужен для правильного расчета дополнительного зачета НДС; - итоговая сумма НДС определяется по итогам налогового периода в соответствии со ст. 502 НК РК; - наличие положительного сальдо по одному КБК само по себе не означает, что сумма автоматически зачтется в счет НДС по другой деятельности. Порядок отражения операций по начислению, уплате, зачету и формированию сальдо регулируется ст. 118 НК РК и Правилами ведения лицевого счета (приказ МФ РК № 637). 

Источник информации : https://www.gov.kz/memleket/entities/kgd-sko/press/news/details/1280853?lang=ru